Struktur organisasi Madrasah Aliyah Darussalam International Boarding School disusun untuk memastikan seluruh program pendidikan berjalan secara efektif, profesional, dan terarah. Di bawah naungan Yayasan MASRA dan Direktorat MDIBS, Kepala Madrasah didukung oleh Kepala Tata Usaha, Bendahara, serta empat bidang wakil kepala madrasah, yaitu Kurikulum dan Penjaminan Mutu, Kesiswaan dan Prestasi, Humas dan Kerjasama Internasional, serta Sarana Prasarana dan Lingkungan Hidup. Masing-masing bidang memiliki koordinator yang bertanggung jawab pada tugasnya sehingga seluruh elemen, mulai dari wali kelas, guru mata pelajaran, hingga santri, dapat bersinergi dalam mewujudkan pendidikan Islam berstandar internasional yang unggul dalam Al-Qur'an, akademik, dan pembentukan karakter."
Harapan Baru, Loa Janan Ilir, Samarinda City, East Kalimantan 75251, Indonesia